Sgt. Keroro, befehlshabender Offizier der Invasionstruppen vom Planeten Keron, hat ein Problem. Nachdem er mit seinem Raumschiff auf der Erde notlanden muss und seine Geheimwaffe, den Quak-Ball, verloren hat, kann er keinen Kontakt mehr zu seiner Heimatwelt aufnehmen. Er findet Unterschlupf bei der Familie Hinata, muss dafür aber die Hausarbeit erledigen. Nebenher schmiedet er Pläne, um seine geheime Mission, die Erderoberung, weiter voranzutreiben!